Gesundheit

Ein tief-Tauchen Sie ein in die Auswirkungen von arthritis-Medikamenten auf die Genexpression: Neue analytische Ansatz könnte als mächtiges Werkzeug zum auswerten und vergleichen-Behandlungen

Eine neue computational framework hat gezeigt, wichtige Unterschiede zwischen den vier rheumatoide arthritis Medikamente und Ihre Auswirkungen auf die biologische pathways in Mäusen. Niki Karagianni von Biomedcode Hellas SA, Griechenland und Kollegen präsentieren Ihre neue Vorgehensweise und Ergebnisse in PLOS Computational Biology.

Menschen mit rheumatoider arthritis erhalten oft Medikamente, die Ziel und hemmen Tumor-Nekrose-Faktor (TNF), ein protein, beteiligt an der schmerzhaften und schädigenden Entzündung charakteristisch für die Krankheit. Während mehrere anti-TNF-Präparate sind weit verbreitet mit vergleichbaren klinischen Erfolg, die details Ihrer verschiedenen molekularen Auswirkungen auf die biologischen Prozesse sind unklar.

Um diese Lücke zu füllen, Karagianni und Kollegen beschäftigt ein Maus-Modell der chronisch-entzündlichen polyarthritis — Mäuse exprimieren das humane TNF und Symptome entwickeln und Signaturen, die eng Spiegel der menschlichen form der Krankheit. Die erkrankten Mäuse erhielten eine Behandlung mit einer der vier anti-TNF-Präparate (Remicade, Cimzia, Humira oder Enbrel), oder zum Vergleich, keiner von den Drogen. Die Forscher verglichen Sie mit gesunden Mäusen.

Nach der Behandlung, die die Forscher gesammelt Gelenk-Gewebe von allen Mäusen und Analysierte Ihre transkriptoms — das komplette set von messenger-RNA-Moleküle in dem Gewebe, das anzeigt, welche Gene aus-oder eingeschaltet werden. Dann wendeten Sie eine Reihe von rechnerischen Schritte, um die Transkriptom-Daten vergleichen, um die Effekte der vier verschiedenen Drogen.

Die Analyse ergab, dass bisher unbekannte Unterschiede in der Art der vier Wirkstoffe beeinflussen die gen-expression in erkrankten Mäusen. Einige dieser Unterschiede wurden für die Gene direkt beteiligt arthritis, aber viele fanden sich in nicht-arthritis-related Gene, wie Gene im Herz-Kreislauf-Erkrankungen und anderen Bedingungen, die auftreten können, neben der arthritis.

„Vielleicht das wichtigste Ergebnis aus unserer Studie ist die große Anzahl der down-regulierten Gene in den erkrankten Tieren, die im Zusammenhang mit Funktionen und Wege, die waren bis vor kurzem weitgehend übersehen“, sagt Studie co-Autor Christoforos Nikolaou. „Diese könnten zusätzliche Einblicke in arthritis Pathologie Mechanismen.“

Die neue computational framework entwickelt, für diese Studie konnte eingesetzt werden für detaillierte Vergleiche von anderen Medikamenten bei anderen Krankheiten. Damit dies leichter möglich ist, die arbeiten die Forscher daran, zu organisieren, die das system in einem automatisierten standalone-Paket.