Gesundheit

Neues Werkzeug für das Verständnis der Zellen in Gesundheit und Krankheit: Ein first-of-its-Kind-Daten Analyse-Plattform hilft, den Sinn der gewaltigen Mengen von Daten generiert, durch die single-cell-Forschung

Ein first-of-its-Kind-Daten Analyse-Plattform ermöglicht es Forschern, wählen Sie das beste Werkzeug für die Interpretation der gewaltigen Mengen von Daten generiert, durch die single-cell research. Genau darin einen Sinn, diese Informationen helfen, um zu erklären, die Vitale und abwechslungsreiche Aufgaben-Zellen spielen in Gesundheit und Krankheit. Die Plattform, CellBench, wurde veröffentlicht in der Natur-Methoden.

Die frei zugängliche Plattform, die software und mehrere gold-standard-Datensätzen, ermöglicht den Vergleich der Leistung von tausenden von verschiedenen single-cell-Analyse-Möglichkeiten, um zu helfen Forscher identifizieren der besten Methode für die Fragen, die Sie beantworten möchten.

Das Projekt wurde unter Leitung von Associate Professor Matthew Ritchie und Herr Luyi Tian von der Walter und Eliza Hall Institute of Medical Research, zusammen mit Dr. Kim-Anh Lê Cao und Herr Al J Abadi an der Universität von Melbourne.

Viel ist noch unbekannt über die Billionen von Zellen im menschlichen Körper. In der quest um besser zu verstehen, Zellen und Ihre Rolle in Gesundheit und Krankheit, eine Technik, genannt single-cell sequencing hat sich ein heißes Forschungsgebiet.

In den vergangenen fünf Jahren hat es eine explosion von neuen Analyse-tools für die Interpretation der single-cell data. Das hat die Forscher mit Hunderten von Optionen zu wählen zwischen, die in der schwierigen Aufgabe der Interpretation großer und komplexer Biologischer Datensätze.

Associate Professor Ritchie sagte, die Fähigkeit zum erkennen und definieren der einzelnen Zelle und Ihre Aktivität war von unschätzbarem Wert für die Vermeidung und Behandlung von Krankheiten.

„Die Herausforderung ist, dass so eine kolossale Menge von komplexen biologischen Daten, generiert aus den Einzel-Zell-Studien.

„Unsere Plattform bietet eine Lösung für das von den Forschern helfen, genau und effizient den Sinn der gewaltigen Mengen an Informationen aus Ihren Studien,“ sagte er.

Dr. Kim-Anh Lê Cao sagte, die Wahl der richtigen Daten-Analyse-tool ist entscheidend für die Vermeidung von irreführender Ergebnisse oder der falschen interpretation Biologischer Daten.

„Eine der größten Herausforderungen, denen wir in diesem Bereich der Forschung ist die Fähigkeit zu vergleichen, die Effizienz aller Analyse-Methoden, die derzeit verfügbar sind. Dies kann nur getan werden, wenn wir gute Daten wie CellBench zu tun, das benchmarking.

„CellBench ist schon so dass Forscher wählen die richtige Analyse-Methode und generieren Sie aussagekräftige und genaue Schlussfolgerungen aus Ihren Daten,“ sagte Sie.

Associate Professor Ritchie sagte, es war klar, es war ein echter Bedarf für ein single-cell-Analyse-benchmarking-tool, weil das team die Studie hatte bereits heruntergeladen, mehr als 3.000 mal auf einem preprint-server für die Biologie genannt bioRxiv und dass Ihre Daten bereits vorgestellten in fünf anderen Studien.

„Wir sind sehr erfreut zu sehen, die rasche übernahme und Nutzung der Daten aus unserem CellBench Projekt“, sagte er.

Die Forscher hoffen, dass die Plattform dient der Förderung einer strengen Prüfung, was zu einer besseren Qualität der Daten-Analyse-Methoden entwickelt, in die Zukunft. Letztlich ist Ihre Hoffnung ist, dass die Plattform Unterstützung der Forscher bei, neue Entdeckungen zu machen und die Entwicklung effektiver Therapien für die großen gesundheitlichen Herausforderungen unserer Zeit.

Die Forschung wurde unterstützt durch den Chan Zuckerberg-Initiative und der Australian Government ‚ s National Health and Medical Research Council.